有機(jī)系抗菌劑主要是酯類、醇類、有機(jī)酸、酚等物質(zhì)；有機(jī)抗菌劑種類繁多，多達(dá)500余種，而常用的有機(jī)抗菌劑只有幾十種，依據(jù)化學(xué)分子結(jié)構(gòu)可以將有機(jī)抗菌劑分成20余大類，部分常用有機(jī)抗菌類別及主要產(chǎn)品見下表

    抗菌劑抗菌機(jī)理主要是與病原微生物細(xì)胞膜表面的陰離子相結(jié)合或與巰基反應(yīng)從而破壞蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)或影響生物膜的合成，以此來抑制病原微生物的繁殖。目前來說，有機(jī)抗菌劑仍然占據(jù)這抗菌系列產(chǎn)品的主導(dǎo)地位，并廣泛應(yīng)用于污水處理、醫(yī)療環(huán)保、木材防腐、建材防銹等各領(lǐng)域。

    有機(jī)抗菌劑的作用優(yōu)點(diǎn)是產(chǎn)品種類繁多、及時(shí)性好、殺菌力強(qiáng)；缺點(diǎn)是耐熱性較差、毒性大，可使病原微生物產(chǎn)生耐藥性。由于近年來天然產(chǎn)物抗菌劑研發(fā)力度加大以及無機(jī)抗菌劑的低毒、環(huán)境友好型優(yōu)勢(shì)，使得有機(jī)抗菌劑的研發(fā)處于停滯不前的狀態(tài)，市場(chǎng)需求也有所下降。一般被認(rèn)可的有機(jī)抗菌劑的作用機(jī)制可歸納為以下3種：

1、作用于生化反應(yīng)所需的蛋白酶或其他生物活性物質(zhì)；

2、作用于遺傳物質(zhì)DNA或其他遺傳微粒結(jié)構(gòu)；

3、作用于生物膜系統(tǒng)或細(xì)胞壁。

    季銨鹽類能夠吸附帶有負(fù)電荷的病原微生物，破壞微生物細(xì)胞壁機(jī)構(gòu)，使內(nèi)容物外泄。此外，季銨鹽還具有抑制病原菌氧化酶、脫氫酶等作用。

    醇類有機(jī)抗菌劑殺菌機(jī)制是能夠去除病原微生物膜中的脂類物質(zhì)并使蛋白質(zhì)變性，其中最常用的為乙醇，其體積分?jǐn)?shù)為75%時(shí)殺菌力最強(qiáng)，當(dāng)濃度過高時(shí)，能使病原微生物表面蛋白質(zhì)發(fā)生迅速凝固，殺菌效果反而下降。

    氯已啶是常用的雙胍類殺菌劑，低濃度時(shí)能夠破壞細(xì)胞膜，使胞質(zhì)內(nèi)容物漏出，而高濃度可以使病原微生物體內(nèi)蛋白質(zhì)凝固。

    雙乙酸鈉是一種光譜、高效的抗菌劑，尤其對(duì)黃曲霉素的抗性作用最為突出，當(dāng)雙乙酸鈉穿透微生物細(xì)胞壁，進(jìn)入微生物細(xì)胞，干擾細(xì)胞內(nèi)酶的生物合成，可以高效抑制多種霉菌和細(xì)菌的分裂繁殖和蔓延。

    吡啶鹽的功能基團(tuán)能與與細(xì)菌之間產(chǎn)生靜電相互作用，即生態(tài)捕捉作用。

    喹諾酮滲透進(jìn)入細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)，抑制保持DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)的DNA旋轉(zhuǎn)酶。

    苯并咪唑類，能夠干擾病原微生物有絲分裂過程，主要是能夠抑制紡錘體的形成，進(jìn)而影響病原微生物細(xì)胞分裂過程。

    有人認(rèn)為可以用烷基化反應(yīng)解釋醛類殺菌活性，2個(gè)醛基的存在是其具有殺菌活性的必要條件，二醛的殺菌活性與鏈長(zhǎng)有關(guān)，鏈長(zhǎng)增加，殺菌活性下降。

    戊二醛的殺菌機(jī)理屬于例外，通常被認(rèn)為與病原微生物細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)相互交聯(lián)作用，主要發(fā)生交聯(lián)作用的有機(jī)成分是氨基與醛基反應(yīng)，其他可以參與交聯(lián)作用的活性基團(tuán)有亞胺基、巰基等。戊二醛首先作用與外層細(xì)胞膜。導(dǎo)致細(xì)胞膜的通透性發(fā)生改變，細(xì)胞內(nèi)環(huán)境中活性物質(zhì)種類數(shù)量發(fā)生改變，而且還會(huì)破壞病原微生物酶系統(tǒng)，干擾阻礙DNA等遺傳物質(zhì)的化學(xué)合成以及轉(zhuǎn)錄翻譯合成蛋白質(zhì)的過程。